مؤسسه علامه حلی فعالیت خود را در سال ۱۳۸۵ به طور رسمی آغاز کرد. در این سال تعدادی از معلمان با دغدغه «آموزش استعداد درخشان» دور هم جمع شدند و مؤسسه علامه حلی را تأسیس کردند. این معلم‌ها که خودشان از دانش‌آموختگان مدارس استعدادهای درخشان شهر تهران هستند، سال‌ها در مدارس سمپاد (سازمان ملی پرورش استعدادهای درخشان)، به دنبال پیاده سازی روش‌های مؤثر و جدید آموزش بوده‌اند و در نهایت تصمیم گرفتند تا نتیجهٔ این تجربیات را در مؤسسه علامه حلی در اختیار دیگر فعالان عرصه آموزش بگذارند. سؤال مهمی که ممکن است برای همهٔ شما پیش بیاید، ارتباط یا عدم ارتباط مؤسسه علامه حلی با مدارس سمپاد (اکثر این مدارس با نام‌های «علامه حلی» برای پسران و «فرزانگان» برای دختران فعالیت می‌کنند) است. در این باره باید گفت: «مؤسسه آموزشی علامه حلی، مؤسسه غیر انتفاعی است که ارتباط دولتی و رسمی با مدارس علامه حلی و فرزانگان ندارد، اما با توجه به این که مؤسسین این مجموعهٔ آموزشی، جمعی از فارغ‌التحصیلان قدیمی و دبیران این مدارس با هدف آموزش عمیق و مفهومی هستند، بنابراین فعالیت‌های مؤسسه علامه حلی و مدارس سمپاد در یک راستا است. اما همهٔ دانش‌آموزان برتر و سخت‌کوش می‌توانند از خدمات این مجموعه استفاده کنند.